Repozytorium

Investigations of an O—H···S hydrogen bond via Car-Parrinello and path integral molecular dynamics.

Autorzy

Aneta Jezierska

Jarosław J. Panek

Rok wydania

2009

Czasopismo

Journal of Computational Chemistry

Numer woluminu

30

Strony

1241-1250

DOI

10.1002/jcc.21158

Kolekcja

Naukowa

Język

Angielski

Typ publikacji

Artykuł

Streszczenie

The presence of intramolecular hydrogen bonds influences the binding energy, tautomeric equilibrium, and spectroscopic properties of various classes of organic molecules. This article discusses the OH · · · S bridge, one of the less commonly investigated types of intramolecular interactions. 3‐mercapto‐1,3‐diphenylprop‐2‐en‐1‐one was considered as the model structure. This compound exhibits photochromic properties. Car‐Parrinello molecular dynamics (CPMD) was applied to investigate the spectroscopic and molecular properties of this compound in the gas phase and in the solid state. The second part of the study is devoted to the effects of the quantization of nuclear motions, with special attention to the OH · · · S moiety. Path integral molecular dynamics (PIMD) of the molecular crystal of 3‐mercapto‐1,3‐diphenylprop‐2‐en‐1‐one was carried out for this purpose. The employment of this fully quantum mechanical technique enables one to study, in a time‐averaged sense, the zero‐point motion important for flat potential energy surfaces. Finally, the potentials of mean force (Pmfs) were calculated from the CPMD and PIMD data obtained for the solid‐state calculations. The effect of including quantum nuclear motion was investigated. In the studied compound, quantum effects shortened the H‐bridge and provided a better description of the free energy minimum. The computational results place this uncommon intramolecular H‐bonding among the class of strong hydrogen bonds with large red shifts of OH stretching modes, which correspond well with previously presented experimental data in the literature concerning this structure.

Słowa kluczowe

intramolecular hydrogen bond, Gas phase, solid state, DFT, CPMD, PIMD, Pmf

Adres publiczny

https://doi.org./10.1002/jcc.21158

Strona internetowa wydawcy

onlinelibrary.wiley.com/

Podobne publikacje
2020

Symmetry/asymmetry of the NHN hydrogen bond in protonated 1,8-bis(dimethylamino)naphthalene.

Piękoś Patrycja, Jezierska Aneta, Panek Jarosław J., Goremychkin Eugene A., Pozharskii Alexander F., Antonov Alexander S., Tolstoy Peter M., Filarowski Aleksander

  • 17
    Luty 2021
    12:00

    Publiczna obrona rozprawy doktorskiej mgr Aleksandry Marszałek-Harych

    zdalnie (MS Teams)
  • 02
    Luty 2021
    10:15

    1. Posiedzenie Rady Dyscypliny Naukowej

    ZAPROSZENIE Uprzejmie zapraszam na 1. Posiedzenie Rady Dyscypliny Naukowej, które odbędzie się dnia 2 lutego 2021 r. o godz. 10:15 w trybie zdalnym Porządek obradI. Sprawy osobowe: Omówienie sprawy odwołania pana mgr. Khalila S.M. ...

    zdalnie (MS Teams)
  • 20
    Styczeń 2021
    12:00

    Publiczna obrona pracy doktorskiej mgr Klaudii Mencel

    zdalnie (MS Teams)
  • 10
    Listopad 2020
    10:15

    Zaproszenie na 4. nadzwyczajne posiedzenie Rady Wydziału

    zdalnie
  • 27
    Październik 2020
    10:15

    Zaproszenie na 6. posiedzenie Rady Wydziału w dniu 27 października

    Wrocław, dnia 21 października 2020 r.          ZAPROSZENIE Uprzejmie zapraszam na 6. posiedzenie Rady Wydziału, które odbędzie się dnia 27 października 2020 r.  o  godz. 10.15    (tryb zdalny)   Porządek dzienny: 1. ...

    zdalnie